剛畢業的醫學院學生保本（加山雄三 Yuzo Kayama 飾），在父親的介紹下，來到窮山惡水的小石川診所實習。他的老師是一名被稱作紅胡子（三船敏郎 Toshiro Mifune 飾）的古怪醫師。起初，向往長崎的保本對這個貧民窟厭惡之極，并遷怒于紅胡子，覺得自己受騙受騙，無用武之地。紅胡子是這里遠近聞名的杏林高手，他沒有對保本提甚么要求，而是默默地行醫，不畏權貴，不計酬勞，手下治愈的病人不可勝數，其中包括因受虐精神失常的少婦（香川京子 Ky?ko Kagawa 飾），因酗酒導致半身麻木的醉漢，因被販賣至青樓身患性病的雛妓等等。在協助紅胡子治病救人的過程當中，保本逐漸發現了醫德的重要，并修正了自己的人生態度……