大學教授·大島健藏(久松信美飾)在東京都內的巷子里被不明身份的人刺殺，警視廳搜查一課·十津川警官(高橋英樹 飾)和龜井刑警(高田純次 飾)則親臨現場。根據第一發明者，被害者是“十津川…”說完就斷氣了。大島是有名的“線粒體學”第一人，但十津川卻素昧生平…。十津川一邊困惑一邊開始搜查，在現場附近的監控錄像中發明了可疑男子的身影。為了尋找線索，十津川等人詢問了副教授早瀨由美(黑谷友香 飾)和支援研究的生物相關公司社長中園宏司(中村俊介飾)，得知了使人震驚的事實。監控錄像中的男子，必然是兩人的兩小無猜·赤池莊五郎(松尾諭飾)。由美、中園、赤池3人是北海道·新十津川町身世，3人發誓永遠的友情，但由美和中園以大學升學為契機來到東京。據說只有赤池留在當地繼承了農業。赤是認真地進行品種改良,因此詳細大島由美在農作物教授先容了的,但大島是品種改良的為了咨詢經常來訪赤為了整肅“不久的家伙”,他的盡力“小學生的“自由研究水平和部落。大島教授在臨死前留下的話=“十津川”是指赤池嗎?!?以后，為了追尋逃往故鄉的赤池的蹤跡，十津川和龜井也前去新十津川町?？墒牵喑鼐谷荒弥C槍闖入了街道事務所，把街道的資產家浦野典史(螢火蟲雪次朗)等人作為人質關在那里。這時由美想阻止好友暴走，十津川為了珍愛她，把槍口對準了赤池…!赤池對對峙的十津川說:“撤銷札沼線的廢止!”赤池的真正用意是……!?緊接著，在遙遠的東京，又發生了一路悲劇……!?