萌學園，傳說成立的時間是在地球誕生的年代，是一所由夸克族人組成的魔法學校，隱藏在地球大氣層外平行空間里，并由現任萌騎士幻之星（李昂霖 飾）、炎之星（劉書宏 飾）、智之星（林奕勛 飾）、十之星（阿本 飾）、月之星（彩虹 飾），代代相傳，守護地球的和平。在一次搶救魔法生物的使命中，意外引來宇宙中的黑色氣力莫爾斯（傅冠杰 飾），威脅萌騎士交出磐古，召喚出萌學園的過去，否則將用魔法抽干地球水資源，讓所有生命干涸而死！磐古，究竟是甚么？為了拯救地球，萌騎士踏上尋找磐古的旅程，竟發現磐古的神秘氣力與自己的魔法有著密不成分的連接結，然而要支出甚么價格才能阻止莫爾斯奪走磐古？與萌騎士一路面對跟地球共存亡的環節戰役！