“TOKYO MER”正式認可半年。為了在天下政令指定城市開展MER，取代離開隊伍的音羽（賀來賢人 ）的第二大夫問題讓喜多見（鈴木亮平 ）頭痛不已。在隊伍內希望比奈（中條綾美）升格的聲音也提高，可是，音羽斷言比奈應該向循環器外科的道前進。比奈也感到壓力，煩惱著能不行取代音羽。這時，青戶（伊藤淳史）作為支援大夫來到MER。青戶和音羽一樣是厚生勞動省的醫科技術官，表面上是作為第二大夫候補的派遣，但那里有厚生勞動省方面的想法。就在這時，隅田川發生了大型水上巴士和屋形船的碰撞變亂。載著很多傷員，失去控制的屋形船暴走了。雖然是趕往現場的MER的成員們，可是因為不行接舷，所以不行進入。并且由于船底內部的燃料泄漏，裝載了很多的患者爆炸的可能性被發現！喜多見等報酬了救助被遺棄的人們，進行了意料以外的作戰。那正是殊死的挑戰。