故事產生在天保14年的江戶。當時在老中?水野忠邦實施的財政緊縮政策之下的老百姓生活在極度困扃中。國內government的榨取，加上外國殖民者入侵的威脅，在江戶的街頭巷尾中彌漫著一種不安的氣氛。在不為眾人所知的地下，存在著一個秘密的神社。這個神社表面上對外稱是對外國傳入的學術文化進行研究調查的『蠻社改所』，而實際上則是專門對付各國潛入日本的『妖夷』，并負責將他們秘密抹殺的government隱蔽機關。該組織的頭目名為小笠原放三郎，是個醉心于“蘭學”，并極力證明實在用性的學者。然而卻不能不聽從南町奉行?鳥居耀藏的差遣。小笠原雖然沒有了得的身手，但卻與有著能將漢字中蘊藏的難以想象氣力“漢神”誘導而出并具現化的高超能力的“妖奇士”龍導往壓等人承擔著暗中珍愛江戶的職責...