三國時期，戰火紛起。年輕的華佗在家鄉亳州給百姓看病，過著自由灑脫的日子。華佗高手讓太守女兒明心起死復生，獲得了神醫美名，也從此與明心結下不解之緣。為了研制麻沸散給明心治療眼睛，華佗開始游歷尋藥。在都城，華佗與英雄關羽、奸雄曹操和師兄吳思德屢有交集，見識了官場險惡，人情冷暖。最讓華佗痛心的是，心愛的姑娘明心慘遭吳思德霸占。在東吳山中，絕望的華佗受隱者指點，幡然醒悟，立志成為醫人醫心醫國的蒼生大醫。赤壁之戰，刮骨療毒，秘境歷險。聽憑風吹雨打，從不曾改變拯救蒼生的赤子之心。麻沸散的研制成功，也讓華佗和明心的愛情修成正果，可就在幸福來姑且，曹操因病、因疑、因恨抓走了華佗，這位行醫濟世、藥到病除的蒼生大醫逝于囚牢。