唐朝麟德年間，唐高宗（盛鑒 飾）與武則天（劉嘉玲 飾）強硬派出大軍遠征，誰知艦隊在大海中遇襲，遭到重挫。該事務震驚洛陽，都城百姓狂熱祭拜龍王，繚亂眾生的“花魁”銀睿姬（楊穎 飾）更惹來各方勢力覬覦。狄仁杰（趙又廷 飾）奉武后之命調查龍王一案，偏巧卷入綁架銀睿姬的案件當中。在與劫匪搏殺過程當中，狄仁杰遭遇亦敵亦友的大理寺卿尉遲真金（馮紹峰 飾），遂被對方投入大牢。銀睿姬一案內龍王身影再現，使洛陽上空更添一道疑云。獄中狄仁杰憑借縝密推理博取回紇醫工沙陀忠（林更新 飾）的信任，逃出大牢同查龍王真相。兩起案件撲朔迷離，相互糾纏，引向全然未知的方向……