此版《源氏物語 千年之謎》由鶴橋康夫執導，不但使用CG，還加入動作場面和科幻效果，制作費用高達十億多日元(折合錢7千8百多萬)，于2011年12月10日在日本全國公映。影片把原著作者紫式部(中谷美紀 飾)身處的平安時期與光源氏（生田斗真 飾）所在天下相交織，兩條線 索并行。一個空間中紫式部受藤原道長（東山紀之 飾）錄用開始創作《源氏物語》，并與藤原道長發生了愛情牽絆。另一個空間是紫式部創作出的光源氏與藤壺女御（真木陽子 飾）、六條御息所（田中麗奈 飾）、夕顏（蘆名星 飾）等浩繁女性的愛情糾葛。在關閉的創作進程中，紫式部現出了靈魂出竅的狀態，與筆下對光源氏陷入苦戀而化為生靈的六條御息所的靈魂重疊。陰陽師安倍晴明（洼冢洋介 飾）發現了這個情況，開始追蹤生靈……