21世紀末，人類的科技水平已高度發財，克隆人技術和宇宙航行早已實現，不再是夢想。與此同時，許多科學家仍孳孳不倦追索著人類起源的秘密與真相。通過對許多古老文明的考察與對比，科學家伊麗莎白·肖（Noomi Rapace 飾）和查理·赫洛維（Logan Marshall-Green 飾）發明，人類可能是來自一個遙遠星系的外星人締造的。在Weyland公司資助下，他們乘坐維克絲（查理茲·塞隆 Charlize Theron 飾）所掌管的宇宙飛船普羅米修斯號前去那顆未知的星球。經過對當地的考察，地球人的設想成功得到印證。可是他們貿然探查“神的秘密”的行為，也將自己引入萬劫不復的深淵……