宋慈（何冰 飾）參加京試中了進士，預備返家完婚后隨同科好友孟良臣（吳軍 飾）赴邊城。豈知，直至完婚那日，宋慈父親宋鞏依舊未歸家。兩位新人正拜堂之際，一輛馬車卻載回了父親的遺體，宋鞏平生從事刑獄審戡，從未失足，卻因一次誤判人命功虧一簣，這是以死謝罪，還留下遺書禁止宋門后代涉足刑獄。豈料，災患叢生，孟良臣在上任途中被謀殺的噩耗傳回。在母親的勸導下，宋慈動身邊城，為摯友查明結案情，還它清白。由此，宋慈被破格提升為大理寺正六品主事，后又被錄用外省提點刑獄。宋慈接連查明偵破了“太平縣冤案”、“李府連環案”、“毛竹塢無頭案”、“城南井尸案”、“遺扇嫁禍案”、“梁雨生命案”、“李玉姑失蹤案”等一樁又一樁的懸案……