公元2035年，人類被12只猴子軍研制的一種病毒侵襲，大部分人類都在這場(chǎng)病毒災(zāi)難中死亡，只有少數(shù)人僥幸逃生，但也只能在陰暗的地下，敷衍塞責(zé)。科學(xué)家們決議派人穿越時(shí)光回到1996年追查12只猴子軍的來(lái)歷。囚徒詹姆斯·科爾(布魯斯·威利斯 Bruce Willis 飾)被 挑選為志愿者。鬼使神差，科爾回到了1990年，當(dāng)他向當(dāng)時(shí)的人們描述未來(lái)的那場(chǎng)大災(zāi)難時(shí)，被當(dāng)作神經(jīng)病捉了起來(lái)并被大夫凱瑟琳·雪莉（瑪?shù)铝铡に雇?Madeleine Stowe 飾）診斷為精神割裂癥。科爾在病友杰弗里·戈因斯幫助下逃脫，回到了未來(lái)。因?yàn)闆]查清12只猴子軍的來(lái)歷，科爾再次被派回了1996年。科爾這次發(fā)現(xiàn)了12只猴子軍的起源地在費(fèi)城，他找到了大夫凱瑟琳，二人一路展開了追查12只猴子軍的冒險(xiǎn)之旅!