經過北國小島上和鷹岡的決戰，3年E班的各位與殺老師（福山潤 配音）的關系進一步拉近。雖然暗殺活動仍在繼續，然而這似乎已經釀成了師生之間互動玩樂的重要環節。以茅野楓（洲崎綾 配音）為代表的學生們又開始策劃更加精彩的暗殺陷阱。除此以外，他們幫助比琪老師（伊藤靜 配音）追求烏間惟臣（杉田智和 配音），又或者磨刀霍霍與A班的精英們展開榮譽與尊嚴之戰。與此同時，白師長帶領堀部系成（緒方惠美 配音）東山再起，而神秘的死神則將E班推向各位陰險的境地。隨著最后期限一天天逼近，殺老師和學生們的關系變得愈加微妙……本片根據松井優征的超人氣漫畫改編。