第28屆大眾電影百花獎最佳男主角獎
第11屆中國電影華表獎優秀男演員獎

1982年，吳軍在湖南省桃江縣花鼓戲劇團工作，主演了《小放牛》、《五女拜壽》等劇，獲湖南省益陽地區現代戲創作匯演優秀演員特別獎，當地觀眾都愛稱他是“十二歲紅”。

1990年，20歲時在湖南省藝校學習期間，因主演《花子奇遇》獲湖南省中專文藝學校匯演優秀表演一等獎。

1993年，他又以《女杰賀英》中的出色表演獲得了湖南省文藝團體調演最佳配角獎。同年帶職考入中央戲劇學院導演系深造，系統的訓練和理論上的完善，為他打下了扎實的話劇表演基礎。

1995年，從中央戲劇學院畢業，剛出道就與士兵結下了不解之緣。他拍攝的第一部電視劇就是《士兵今年十八九》，也因為這個角色，1995年被南寧戰友話劇團特招入伍。

1996年，與劉佩琦、宋春麗共同主演弘揚雷鋒精神的電影《離開雷鋒的日子》，在劇中飾演雷鋒。

1999年，與張國立、鄧婕主演古裝斷案劇《康熙微服私訪記2》，飾演三德子。

2001年，在羅剛、劉敏濤主演的軍旅題材劇《我們的連隊》中飾演丁雷。同年在洪劍濤、周小斌、范明主演的中國第一部軍旅題材的情景喜劇《炊事班的故事》中客串小毛老鄉。在雷恪生、胡可主演的現代都市生活故事的電影《聊聊》中飾演李貴。

2002年，在李保田、沈傲君、杜雨露主演的電視劇《神醫喜來樂》中飾演德福。同年在張國立、鄧婕、李成儒主演《我這一輩子》飾演日本士兵。在古裝探案劇《大宋提刑官》中飾演孟良臣。

2003年，參演李幼斌主演電影《驚心動魄》。

2004年，與唐國強主演大型革命歷史題材影片《張思德》，在劇中飾演張思德，塑造了一個做事勤懇、不善言辭、一心為人民燒炭的質樸形象，憑借該片獲得第28屆大眾電影百花獎最佳男主角獎和第11屆中國電影華表獎優秀男演員獎。同年主演電視劇《水兵俱樂部》，飾演可親、可愛的俱樂部主任羅運來。

2006年，在吳京、商蓉、寧靜主演的古裝言情武打電視劇《鼓上蚤時遷》中飾演矮腳虎王英。同年與句號、莫言主演喜劇電影《天降橫財3》，還主演電影《裝修良緣》、《村支書張仁和》。

2007年，在改編自大革命時期的真實事件的電影《革命到底》中飾演阿貴。同年在講述支教故事的電影《天那邊》中飾演鄉村老師羅吉偉。

2008年，主演根據2007年度感動中國十大人物之一謝延信的真實事跡編寫的電視劇《好人謝延信》。同年在李晨、雅琦主演的軍旅劇情片《立正》中飾演班長董喜財。

2009年，在反映合肥改革開放30年輝煌成就的電視劇《壩上街》中飾演束維貴。同年在張一山、成龍主演的電影《尋找成龍》中飾演洪哥。吳軍

2010年，與孫遜、張晶晶主演電視劇《生死歸途》，在劇中飾演牛大奎。同年在《旱碼頭》中飾演郭四勝。在鄭曉龍執導，胡軍、周韻主演的年代劇《金婚風雨情》中飾演楚建。在愛情生活片《戰地黃花分外香》飾演王家輝。在楊亞洲執導，倪萍、劉佩琦、蔣勤勤主演電影《大太陽》中飾演梅鄉長。主演全國“情系農民工關愛留守兒童”影視文化送溫暖行動系列電影的第二部《愛上油菜花》。

2011年，主演電影《云中崗亭》。在以天津市優秀教師、全國教書育人楷模徐英杰為原型的電影《徐老師的故事》中飾演徐老師。在《建黨偉業》客串剃頭匠。

2012年，在滕華濤執導，殷桃、趙子琪主演的都市時尚劇《時尚女編輯》中飾演萬總。主演家庭情感劇《老爹的非誠勿擾》。再次與李保田合作出演《神醫喜來樂傳奇》，仍在劇中飾演德福。出演向黨的十八大獻禮的影片《雨中的樹》。主演國內首部以小龍蝦養殖為題材的電影《潛江紅》。