第3集劇情:林肯再次逃脫 亨特進入九頭蛇

　　林肯施展異能，總算逃脫了黑色行動隊的追捕。但黑色行動隊所屬的ATCU組織將他的照片和信息全國發布，稱他是外星殺人犯。黛西打電話給林肯，想幫助他。可林肯馬上掛斷電話，并摔碎手機，去掉了身上被神盾局埋下的聯絡跟蹤器。亨特和梅去找能幫他們聯系到九頭蛇組織的斯巴德，探聽到了有用的信息。西蒙斯重返之后，由于長期呆在了另一個星球，身體機能發生了一系列變化。為了幫她恢復，菲茲帶她去實驗室轉轉，結果當她看到曾用來做傳送門的巨石，現在雖已經碎裂成一堆石頭，還是產生了反應，她曾經最愛的實驗室也讓她感覺不適。大家知道她有很多事沒有說出來，比如，她是如何獨自在另一個星球活下來的。但大家尊重愛護她，決定等待，到她自己想說的時候再聽。林肯躲到了一個朋友家，但當朋友從電視上得知他就是那個外星殺人犯，于是打了熱線電話。林肯逃跑時他因受到了驚嚇而死，林肯感到十分內疚。林肯打電話給黛西，訴說了自己的心境。菲爾約了羅莎琳見面，她就是政府的秘密組織ATCU的總負責人，她所領導的黑色行動隊總是在異能人出現的時間趕到，并將他們帶走。神盾局的人懷疑他們將這些異能人殺害并研究，美其名曰為了給國民以安全感。這次見面，菲爾想勸她同意神盾局將林肯帶走，但羅莎琳還是拒絕了。菲爾還想請求她一件事，不要透露出黛西的信息，他知道羅莎琳手里有張醫院的照片，如果她將之公布，黛西的安全也將受到威脅。黛西和邁克趕到去營救林肯，黑色行動隊的人也到了。黛西想說服他不要再陷入對朋友之死的內疚，跟著她走。她表達了一直以來對他的愛情，當黛西成功說服林肯，準備帶他撤離時，邁克進來告訴她計劃有變，菲爾讓把林肯交給黑色行動隊。林肯再次使用異能逃脫。當黑色行動隊又準備對付黛西時，菲爾選擇了以后跟他們一起合作做為條件，才保全了黛西。菲茲帶西蒙斯去吃他精心準備的浪漫晚餐。西蒙斯突然哭了，菲茲摟住她安慰著。她離開得太久，有很多事需要重新適應。亨特和梅經過一輪輪血腥殘酷的殺戮，亨特最后被帶到了總部，他將被安排與沃德見面，這正是他們此行的目的。